Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RorbQ8R1B8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RorbQ8R1B8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RorbQ8R1B8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RorbQ8R1B8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RorbQ8R1B8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RorbQ8R1B8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms