Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Otud6bQ8K2H2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Otud6bQ8K2H2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Otud6bQ8K2H2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Otud6bQ8K2H2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Otud6bQ8K2H2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Otud6bQ8K2H2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Otud6bQ8K2H2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Otud6bQ8K2H2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms