Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hacd3Q8K2C9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hacd3Q8K2C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hacd3Q8K2C9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hacd3Q8K2C9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hacd3Q8K2C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hacd3Q8K2C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hacd3Q8K2C9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacd3Q8K2C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hacd3Q8K2C9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hacd3Q8K2C9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hacd3Q8K2C9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms