Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf628Q8CJ78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf628Q8CJ78 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf628Q8CJ78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf628Q8CJ78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf628Q8CJ78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf628Q8CJ78 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf628Q8CJ78 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf628Q8CJ78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf628Q8CJ78 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms