Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpf1Q8CFE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hpf1Q8CFE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hpf1Q8CFE2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hpf1Q8CFE2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hpf1Q8CFE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hpf1Q8CFE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hpf1Q8CFE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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