Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc49a3Q8CE47 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc49a3Q8CE47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc49a3Q8CE47 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc49a3Q8CE47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc49a3Q8CE47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc49a3Q8CE47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms