Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpf31Q8CCF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prpf31Q8CCF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prpf31Q8CCF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpf31Q8CCF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpf31Q8CCF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf31Q8CCF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpf31Q8CCF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms