Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vps53Q8CCB4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vps53Q8CCB4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vps53Q8CCB4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps53Q8CCB4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vps53Q8CCB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vps53Q8CCB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vps53Q8CCB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps53Q8CCB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms