Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slfn5Q8CBA2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Slfn5Q8CBA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slfn5Q8CBA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slfn5Q8CBA2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slfn5Q8CBA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slfn5Q8CBA2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slfn5Q8CBA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slfn5Q8CBA2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms