Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo48Q8CAT8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Fbxo48Q8CAT8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fbxo48Q8CAT8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo48Q8CAT8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fbxo48Q8CAT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fbxo48Q8CAT8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fbxo48Q8CAT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms