Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne1Q8C166 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpne1Q8C166 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpne1Q8C166 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpne1Q8C166 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne1Q8C166 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne1Q8C166 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpne1Q8C166 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cpne1Q8C166 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpne1Q8C166 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms