Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nek11Q8C0Q4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nek11Q8C0Q4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nek11Q8C0Q4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nek11Q8C0Q4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nek11Q8C0Q4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nek11Q8C0Q4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek11Q8C0Q4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek11Q8C0Q4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nek11Q8C0Q4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nek11Q8C0Q4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek11Q8C0Q4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
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