Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp38Q8BW70 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp38Q8BW70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp38Q8BW70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp38Q8BW70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp38Q8BW70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp38Q8BW70 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp38Q8BW70 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp38Q8BW70 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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