Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH97

Rcn3, Reticulocalbin-3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn3Q8BH97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcn3Q8BH97 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rcn3Q8BH97 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rcn3Q8BH97 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rcn3Q8BH97 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rcn3Q8BH97 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rcn3Q8BH97 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms