Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vipas39Q8BGQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vipas39Q8BGQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vipas39Q8BGQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vipas39Q8BGQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vipas39Q8BGQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vipas39Q8BGQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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