Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms