Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zbed4Q80WQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zbed4Q80WQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zbed4Q80WQ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zbed4Q80WQ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zbed4Q80WQ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zbed4Q80WQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbed4Q80WQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbed4Q80WQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms