Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcmf1Q80UY2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcmf1Q80UY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcmf1Q80UY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcmf1Q80UY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcmf1Q80UY2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcmf1Q80UY2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcmf1Q80UY2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcmf1Q80UY2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcmf1Q80UY2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcmf1Q80UY2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcmf1Q80UY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcmf1Q80UY2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcmf1Q80UY2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcmf1Q80UY2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms