Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Polr2eQ80UW8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Polr2eQ80UW8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Polr2eQ80UW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Polr2eQ80UW8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Polr2eQ80UW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Polr2eQ80UW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Polr2eQ80UW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms