Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sestd1Q80UK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sestd1Q80UK0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sestd1Q80UK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sestd1Q80UK0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sestd1Q80UK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sestd1Q80UK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sestd1Q80UK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sestd1Q80UK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms