Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cep170bQ80U49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cep170bQ80U49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cep170bQ80U49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cep170bQ80U49 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cep170bQ80U49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cep170bQ80U49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cep170bQ80U49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cep170bQ80U49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cep170bQ80U49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cep170bQ80U49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cep170bQ80U49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Cep170bQ80U49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cep170bQ80U49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cep170bQ80U49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms