Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mcph1Q7TT79 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mcph1Q7TT79 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mcph1Q7TT79 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mcph1Q7TT79 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mcph1Q7TT79 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mcph1Q7TT79 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mcph1Q7TT79 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mcph1Q7TT79 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mcph1Q7TT79 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms