Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh8Q7TSK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh8Q7TSK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh8Q7TSK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdh8Q7TSK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdh8Q7TSK3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdh8Q7TSK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdh8Q7TSK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdh8Q7TSK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdh8Q7TSK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh8Q7TSK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdh8Q7TSK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh8Q7TSK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms