Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK4

Exosc3, Exosome complex component RRP40, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc3Q7TQK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exosc3Q7TQK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Exosc3Q7TQK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exosc3Q7TQK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exosc3Q7TQK4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc3Q7TQK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc3Q7TQK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc3Q7TQK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc3Q7TQK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc3Q7TQK4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Exosc3Q7TQK4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc3Q7TQK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms