Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sbno2Q7TNB8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sbno2Q7TNB8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sbno2Q7TNB8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sbno2Q7TNB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sbno2Q7TNB8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sbno2Q7TNB8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sbno2Q7TNB8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sbno2Q7TNB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sbno2Q7TNB8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms