Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sys1Q78S06 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sys1Q78S06 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sys1Q78S06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sys1Q78S06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sys1Q78S06 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sys1Q78S06 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sys1Q78S06 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms