Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna2d2Q6PHS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna2d2Q6PHS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna2d2Q6PHS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna2d2Q6PHS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna2d2Q6PHS9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms