Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhb9Q6PB60 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhb9Q6PB60 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bhlhb9Q6PB60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bhlhb9Q6PB60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhb9Q6PB60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhb9Q6PB60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.6 ms