Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM1

Txlna, Alpha-taxilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnaQ6PAM1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TxlnaQ6PAM1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TxlnaQ6PAM1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TxlnaQ6PAM1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TxlnaQ6PAM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TxlnaQ6PAM1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TxlnaQ6PAM1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TxlnaQ6PAM1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnaQ6PAM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnaQ6PAM1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnaQ6PAM1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TxlnaQ6PAM1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms