Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl3Q6P1Y1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl3Q6P1Y1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl3Q6P1Y1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl3Q6P1Y1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rtl3Q6P1Y1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rtl3Q6P1Y1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl3Q6P1Y1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl3Q6P1Y1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms