Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ggnbp1Q6K1E7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ggnbp1Q6K1E7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ggnbp1Q6K1E7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ggnbp1Q6K1E7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms