Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFY8

Brinp2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp2Q6DFY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brinp2Q6DFY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brinp2Q6DFY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brinp2Q6DFY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brinp2Q6DFY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brinp2Q6DFY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brinp2Q6DFY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brinp2Q6DFY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brinp2Q6DFY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brinp2Q6DFY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Brinp2Q6DFY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms