Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrcc1Q69ZB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrcc1Q69ZB0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrcc1Q69ZB0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrcc1Q69ZB0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrcc1Q69ZB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lrrcc1Q69ZB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrcc1Q69ZB0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrcc1Q69ZB0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.2 ms