Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpgs2Q66JT5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs2Q66JT5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpgs2Q66JT5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs2Q66JT5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs2Q66JT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs2Q66JT5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpgs2Q66JT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs2Q66JT5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms