Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc3Q64519 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc3Q64519 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc3Q64519 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc3Q64519 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc3Q64519 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc3Q64519 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc3Q64519 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc3Q64519 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc3Q64519 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc3Q64519 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc3Q64519 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms