Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,96
Atp7bQ64446 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Atp7bQ64446 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Atp7bQ64446 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33,37■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Atp7bQ64446 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Atp7bQ64446 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33,31■■■□□ 2,92
Atp7bQ64446 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33,3■■■□□ 2,92
Atp7bQ64446 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Atp7bQ64446 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Atp7bQ64446 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Atp7bQ64446 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Atp7bQ64446 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Atp7bQ64446 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33,25■■■□□ 2,91
Atp7bQ64446 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Atp7bQ64446 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Atp7bQ64446 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,89
Atp7bQ64446 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Atp7bQ64446 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Atp7bQ64446 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32,93■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Atp7bQ64446 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,9 ms