Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MslnQ61468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MslnQ61468 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MslnQ61468 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MslnQ61468 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MslnQ61468 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MslnQ61468 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MslnQ61468 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MslnQ61468 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MslnQ61468 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MslnQ61468 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MslnQ61468 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MslnQ61468 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MslnQ61468 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MslnQ61468 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MslnQ61468 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MslnQ61468 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MslnQ61468 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms