Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HadhQ61425 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HadhQ61425 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HadhQ61425 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HadhQ61425 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HadhQ61425 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HadhQ61425 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HadhQ61425 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HadhQ61425 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HadhQ61425 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HadhQ61425 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HadhQ61425 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HadhQ61425 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HadhQ61425 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HadhQ61425 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HadhQ61425 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HadhQ61425 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HadhQ61425 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HadhQ61425 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HadhQ61425 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HadhQ61425 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HadhQ61425 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HadhQ61425 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HadhQ61425 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms