Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pde3bQ61409 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pde3bQ61409 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pde3bQ61409 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pde3bQ61409 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pde3bQ61409 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pde3bQ61409 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pde3bQ61409 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pde3bQ61409 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pde3bQ61409 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pde3bQ61409 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pde3bQ61409 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pde3bQ61409 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pde3bQ61409 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde3bQ61409 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms