Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1eQ61290 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna1eQ61290 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna1eQ61290 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1eQ61290 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna1eQ61290 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1eQ61290 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna1eQ61290 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacna1eQ61290 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms