Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgaeQ60677 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ItgaeQ60677 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgaeQ60677 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ItgaeQ60677 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgaeQ60677 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgaeQ60677 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ItgaeQ60677 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms