Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4a4Q5YIR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4a4Q5YIR8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clec4a4Q5YIR8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clec4a4Q5YIR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec4a4Q5YIR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec4a4Q5YIR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clec4a4Q5YIR8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms