Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mybpc2Q5XKE0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Mybpc2Q5XKE0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mybpc2Q5XKE0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Mybpc2Q5XKE0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Mybpc2Q5XKE0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mybpc2Q5XKE0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mybpc2Q5XKE0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mybpc2Q5XKE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mybpc2Q5XKE0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mybpc2Q5XKE0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mybpc2Q5XKE0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mybpc2Q5XKE0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Mybpc2Q5XKE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mybpc2Q5XKE0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mybpc2Q5XKE0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mybpc2Q5XKE0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms