Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bbs12Q5SUD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bbs12Q5SUD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bbs12Q5SUD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bbs12Q5SUD9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bbs12Q5SUD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bbs12Q5SUD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bbs12Q5SUD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms