Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sft2d1Q5SSN7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sft2d1Q5SSN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms