Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TefmQ5SSK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TefmQ5SSK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TefmQ5SSK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TefmQ5SSK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TefmQ5SSK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TefmQ5SSK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms