Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hs3st6Q5GFD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hs3st6Q5GFD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hs3st6Q5GFD5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hs3st6Q5GFD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hs3st6Q5GFD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms