Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ulk4Q3V129 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ulk4Q3V129 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ulk4Q3V129 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ulk4Q3V129 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ulk4Q3V129 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ulk4Q3V129 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ulk4Q3V129 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ulk4Q3V129 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ulk4Q3V129 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms