Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930432M17RikQ3V0W9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930432M17RikQ3V0W9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930432M17RikQ3V0W9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930432M17RikQ3V0W9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930432M17RikQ3V0W9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms