Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ankrd53Q3V0J4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd53Q3V0J4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd53Q3V0J4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd53Q3V0J4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd53Q3V0J4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms