Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX66

7420426K07Rik, RIKEN cDNA 7420426K07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7420426K07RikQ3UX66 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
7420426K07RikQ3UX66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
7420426K07RikQ3UX66 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
7420426K07RikQ3UX66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
7420426K07RikQ3UX66 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
7420426K07RikQ3UX66 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
7420426K07RikQ3UX66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
7420426K07RikQ3UX66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
7420426K07RikQ3UX66 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
7420426K07RikQ3UX66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms